Fosforilação do factor de splicing SRSF1 regula a expressão da variante Rac1b em tumores do cólon

Os nossos genes podem gerar mais do que uma proteína, e desta forma dar origem a um proteoma específico em diferentes tecidos, mas igualmente em tumores durante o seu desenvolvimento. É através do processo de splicing alternativo que os mesmos genes podem expressar proteínas variantes que dão origem a estes proteomas específicos, o que pode ocorrer em mais de 90% dos genes humanos. De um modo geral, sabe-se que a expressão de cada variante é regulada por uma combinação específica de factores de splicing no núcleo das células. O trabalho agora publicado demonstra que, em tumores do cólon, o aumento da expressão da variante Rac1b, uma molécula de sinalização da família das Rho GTPases, é regulado pela fosforilação do factor de splicing SRSF1. Utilizando a técnica do RNAi, foram suprimidas diversas proteínas cinase e identificadas duas indispensáveis para a fosforilação e consequente translocação para o núcleo do factor SRSF1. A identificação destas cinases, SRPK1 e GSK3β, permite agora explorar a relação entre o splicing alternativo e as vias de sinalização, frequentemente alteradas por mutações em tumores.

Autores e Afiliações:
Vânia Gonçalves1,2, Andreia Henriques1,2, Joana Pereira1,2, Ana Neves Costa3, Mary Pat Moyer4, Luís Ferreira Moita3, Margarida Gama-Carvalho2,5, Paulo Matos1,2 and Peter Jordan1,2

1Department of Human Genetics, National Health Institute Dr. Ricardo Jorge, 1649-016 Lisbon, Portugal

2BioFIG–Centre for Biodiversity, Functional and Integrative Genomics, University of Lisbon, 1749-016 Lisbon, Portugal

3Instituto de Medicina Molecular, Faculdade de Medicina, Universidade de Lisboa, 1649-028 Lisboa, Portugal

4INCELL Corporation, San Antonio, Texas 78249, USA

5Department of Chemistry and Biochemistry, Faculty of Sciences, University of Lisbon, 1749-016 Lisbon, Portugal

Abstract:
The majority of human genes can generate various transcripts through alternative splicing. In different tissues or diseases like cancer specific patterns of splicing variants occur and depend on the relative concentrations of the splicing factors in the cell nucleus, either as a consequence of their expression levels or of post-translational modifications, such as protein phosphorylation. Here, we analyzed the contribution of protein kinases to the regulation of alternative splicing variant Rac1b that is overexpressed in certain tumor types. In colorectal cells, we found that depletion of GSK3β, and SRPK1 significantly decreased endogenous Rac1b splicing levels, an effect mediated through changes in splicing factor SRSF1. In particular, the knockdown of SRPK1 or inhibition of its catalytic activity reduced phosphorylation and subsequent translocation of SRSF1 to the nucleus, limiting its availability to promote the inclusion of alternative exon 3b into the Rac1 pre-mRNA. Altogether, the data identify SRSF1 as a prime regulator of Rac1b expression in colorectal cells and provide further mechanistic insight into how the regulation of alternative splicing events by protein kinases can contribute to sustain tumor cell survival.

Revista:
RNA

Link:
http://rnajournal.cshlp.org/content/early/2014/02/17/rna.041376.113.abstract